Sejak awal berdirinya organisasi sudah memutuskan untuk berafiliasi menjadi anggota Jaringan GWL-INA karena memiliki tujuan yang sama yaitu pergerakan dalam isu HIV/AIDS serta hukum dan HAM.
Lembaga Persaudaraan Korban Napza Makassar (L-PKNM) menjalankan program harm reduction guna pencegahan penularan HIV pada pengguna Napza di wilayah Sulawesi Selatan terutama di kota Makassar.
PKBI Sulawesi Selatan mempunyai 12 cabang di daerah Sulawesi Selatan. Program yang dijalankan terdiri dari pemberdayaan remaja, mengembangkan upaya kesehatan Ibu dan anak, upaya pencegahan dan penanggulangan IMS, HIV, dan AIDS.
Yayasan Peduli Kelompok Dukungan Sebaya (YPKDS) Makassar dibentuk dengan latar belakang semakin banyaknya kelompok dukungan sebaya (KDS) di wilayah Sulawesi Selatan terutama di kota Makassar.
Yayasan Gaya Celebes adalah menyebarluaskan informasi tentang pencegahan dan penanggulangan HIV-AIDS dan IMS pada masyarakat secara umum dan komunitas gay dan waria pada khususnya.
Yayasan Spirit Paramacitta mengambil fokus dalam pendampingan kepada orang dengan HIV-AIDS dan Advokasi. Spirit Paramacitta memiliki area kerja di 8 wilayah di Bali
Yayasan Kesehatan Bali (YAKEBA) berdiri untuk membantu pecandu Napza dan alkohol di Bali dengan menyediakan tempat bagi mereka untuk pemulihan dan berhenti dari kecanduannya.
Yayasan Sehat Peduli Kasih menerapkan prinsip GIPA ke dalam praktek kegiatan pemberdayaan ODHA di Jawa Tengah. Semua kegiatan dikembangkan dan dilaksanakan dengan tujuan pemberdayaan dan mendorong ODHA untuk memainkan peran yang lebih aktif.
Yayasan Igama bergerak pada isu kesehatan khususnya penanggulangan epidemi HIV AIDS dan juga pemenuhan hak hak komunitas (HAM).
PKBI Jawa Timur dalam menjalankan strategi dibagi menjadi 3 Program yaitu: Program Layanan ”Klinik Utama PKBI Jawa Timur”, Program Pengorganisasian Masyarakat (Anak – Remaja, Kelompok Rentan dan Masyarakat Umum) dan Program Media, Komunikasi dan Advokasi.
Saat ini Yayasan Orbit melakukan penjangkauan/pendampingan advokasi, rehabilitasi Napza, pendampingan hukum/paralegal pada populasi Penasun dan pekerja seks di wilayah Kota Surabaya dan Kab. Sidoarjo.
Yayasan Mahameru membangun komunikasi melalui penguatan motivasi kepada ODHA di kota Surabaya. Saat ini Yayasan Mahameru berkegiatan sebagai Kelompok Dukungan Sebaya bagi ODHA, dan memfasilitasi kegiatan pendampingan sebaya bagi ODHA
Yayasan Kebaya Yogyakarta berdiri tahun 2006 adalah Yayasan Nir Laba yang bergerak di isu HIV / AIDS, dukungan perawatan ODHIV dalam shelter dan ODHIV luar shelter, Advokasi dan Permberdayaan Transpuan di Yogyakarta.
Berlokasi di Bantul, Yayasan Vesta membuka hotline service untuk memberikan informasi IMS, HIV & AIDS, info layanan test HIV, konseling HIV dan pemberian kondom dan pelicin di Yogyakarta dan sekitarnya.
Yayasan Mentari Sehat Indonesia menjalankan program penanggulangan penyakit menular, seperti TBC, HIV-AIDS, Malaria di 34 kabupaten dan kota di Jawa Tengah.
Pendirian Yayasan ELSA mendapatkan dukungan dari kalangan akademisi, tokoh lintas agama serta masyarakat yang selama ini menjadi korban diskriminasi, baik atas dasar agama, etnis maupun gender.
Srikandi Pasundan Jawa Barat didirikan dilatarbelakangi munculnya beragam permasalahan yang dihadapi oleh komunitas transpuan di Jawa Barat khususnya di Kota Bandung.
Perkumpulan Puzzle Indonesia merupakan organisasi berbasis komunitas yang bermula pada tahun 2006 lewat terbentuknya kelompok dukungan sebaya (KDS) bagi Orang dengan HIV dan AIDS
“LEKAS Bogor Raya” adalah Lembaga Sosial Masyarakat, bergerak dibidang Kajian Kebijakan, Pelakasanaan, dan Pengawasan terhadap pembangunan di Bogor.
Pantura Plus Indonesia adalah sebuah lembaga komunitas masyarakat yang memberikan layanan pemulihan dan rehabilitasi bagi korban penyalahgunaan narkoba di Karawang.