Mnukwar Papua adalah organisasi non-pemerintah yang beranggotakan individu-individu dari berbagai organisasi yang mempunyai kepedulian pada berbagai persoalan dalam pembangunan dan sumber daya alam di Tanah Papua. Organisasi ini berbentuk perkumpulan dan bersifat independen. Mnukwar Papua lahir pada tanggal 29 Maret 2007. Mnukwar Papua dibentuk dengan maksud mendorong adanya
Perkumpulan Bentang Nusantara Papua atau disingkat Bentara Papua didirikan pada tanggal 13 April 2012 oleh beberapa aktivis sosial dan lingkungan di Tanah Papua. Perkumpulan Bentara dibentuk karena berbagai persoalan yang terjadi di Tanah Papua seperti Kemiskinan dan pengangguran, kerusakan ekosistem alam (hutan, lahan, pesisir dan laut)
Perkumpulan Panah Papua adalah organisasi masyarakat sipil yang bekerja memadukan kekuatan advokasi kebijakan, penguatan komunitas melalui pembangunan ekonomi kampung serta pengungkapan kasus kejahatan kehutanan di wilayah perizinan
Perkumpulan Terbatas Pengembangan Masyarakat dan Konservasi Sumber Daya Alam (PERDU) Manokwari merupakan lembaga yang menaruh perhatian pada isu pengelolaan sumber daya alam dan konservasi
Gerakan Masyarakat Papua Lestari (GEMAPALA) merupakan sebuah lembaga yang secara ‘de facto’ didirikan pada tahun 2001. Lembaga ini dibentuk berdasarkan gagasan kumpulan anak muda Kota Fakfak yang berasal dari berbagai profesi dan latar belakang pendidikan